MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Actinosynnema mirum DSM 43827 chromosome

Total Repeats: 259223

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_013093	CGC	2	6	35632	35637	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256374191
1002	NC_013093	GTC	2	6	35697	35702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256374191
1003	NC_013093	GGCG	2	8	35759	35766	0 %	0 %	75 %	25 %	256374191
1004	NC_013093	ACC	2	6	35791	35796	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256374191
1005	NC_013093	CGT	2	6	35822	35827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256374191
1006	NC_013093	ATC	2	6	35913	35918	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256374192
1007	NC_013093	TCG	2	6	35928	35933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256374192
1008	NC_013093	CGCC	2	8	35947	35954	0 %	0 %	25 %	75 %	256374192
1009	NC_013093	CGG	2	6	35961	35966	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256374192
1010	NC_013093	AGGCC	2	10	35968	35977	20 %	0 %	40 %	40 %	256374192
1011	NC_013093	CCG	2	6	35989	35994	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256374192
1012	NC_013093	ATC	2	6	36057	36062	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256374192
1013	NC_013093	GTT	2	6	36089	36094	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256374192
1014	NC_013093	GTC	2	6	36104	36109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256374192
1015	NC_013093	CTG	2	6	36147	36152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256374192
1016	NC_013093	CCA	2	6	36212	36217	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256374192
1017	NC_013093	TGG	2	6	36232	36237	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	256374192
1018	NC_013093	ACG	2	6	36297	36302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256374192
1019	NC_013093	GAA	2	6	36317	36322	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256374192
1020	NC_013093	CGCC	2	8	36346	36353	0 %	0 %	25 %	75 %	256374192
1021	NC_013093	GTG	3	9	36369	36377	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	256374192
1022	NC_013093	CGT	2	6	36382	36387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256374192
1023	NC_013093	CCT	2	6	36394	36399	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256374192
1024	NC_013093	GCG	2	6	36408	36413	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256374192
1025	NC_013093	GCGCT	2	10	36444	36453	0 %	20 %	40 %	40 %	256374192
1026	NC_013093	CTGC	2	8	36464	36471	0 %	25 %	25 %	50 %	256374192
1027	NC_013093	CTG	2	6	36502	36507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1028	NC_013093	CAC	2	6	36556	36561	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1029	NC_013093	TG	3	6	36578	36583	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_013093	G	6	6	36666	36671	0 %	0 %	100 %	0 %	256374193
1031	NC_013093	CGA	2	6	36675	36680	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256374193
1032	NC_013093	CG	3	6	36735	36740	0 %	0 %	50 %	50 %	256374193
1033	NC_013093	ACC	2	6	36752	36757	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256374193
1034	NC_013093	GCT	2	6	36783	36788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256374193
1035	NC_013093	CGGGAG	2	12	36858	36869	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	256374193
1036	NC_013093	AGC	2	6	36877	36882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256374193
1037	NC_013093	TCG	2	6	36905	36910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256374193
1038	NC_013093	CGCC	2	8	36965	36972	0 %	0 %	25 %	75 %	256374193
1039	NC_013093	GGA	2	6	36978	36983	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256374193
1040	NC_013093	GGCG	2	8	36984	36991	0 %	0 %	75 %	25 %	256374193
1041	NC_013093	CG	3	6	36999	37004	0 %	0 %	50 %	50 %	256374193
1042	NC_013093	CGC	2	6	37032	37037	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256374193
1043	NC_013093	CCG	3	9	37040	37048	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256374193
1044	NC_013093	GCA	2	6	37128	37133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256374193
1045	NC_013093	CGC	2	6	37170	37175	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256374193
1046	NC_013093	CCA	2	6	37176	37181	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256374193
1047	NC_013093	GC	3	6	37218	37223	0 %	0 %	50 %	50 %	256374193
1048	NC_013093	TCGG	2	8	37237	37244	0 %	25 %	50 %	25 %	256374193
1049	NC_013093	CAA	2	6	37251	37256	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256374193
1050	NC_013093	GGC	2	6	37272	37277	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256374193
1051	NC_013093	CCG	2	6	37286	37291	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256374193
1052	NC_013093	CGC	4	12	37296	37307	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256374193
1053	NC_013093	CTG	2	6	37387	37392	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256374193
1054	NC_013093	CCA	2	6	37415	37420	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256374193
1055	NC_013093	ACT	2	6	37451	37456	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256374193
1056	NC_013093	ACCCG	2	10	37460	37469	20 %	0 %	20 %	60 %	256374193
1057	NC_013093	CGT	2	6	37554	37559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256374193
1058	NC_013093	CCG	2	6	37562	37567	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256374193
1059	NC_013093	GAT	2	6	37578	37583	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256374193
1060	NC_013093	GCC	2	6	37614	37619	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256374193
1061	NC_013093	CTCG	2	8	37656	37663	0 %	25 %	25 %	50 %	256374193
1062	NC_013093	GCC	2	6	37690	37695	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256374193
1063	NC_013093	CGC	2	6	37713	37718	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256374193
1064	NC_013093	CG	3	6	37832	37837	0 %	0 %	50 %	50 %	256374193
1065	NC_013093	CCT	2	6	37838	37843	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256374193
1066	NC_013093	CCG	2	6	37866	37871	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256374193
1067	NC_013093	GC	3	6	37891	37896	0 %	0 %	50 %	50 %	256374194
1068	NC_013093	CGC	2	6	37919	37924	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256374194
1069	NC_013093	CCG	2	6	37948	37953	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256374194
1070	NC_013093	GAC	2	6	38006	38011	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256374194
1071	NC_013093	CTG	2	6	38013	38018	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256374194
1072	NC_013093	TGC	2	6	38068	38073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256374194
1073	NC_013093	GCA	2	6	38078	38083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256374194
1074	NC_013093	GCC	3	9	38212	38220	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256374194
1075	NC_013093	GC	3	6	38239	38244	0 %	0 %	50 %	50 %	256374194
1076	NC_013093	GC	3	6	38251	38256	0 %	0 %	50 %	50 %	256374194
1077	NC_013093	CCG	3	9	38275	38283	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256374194
1078	NC_013093	CGG	2	6	38402	38407	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256374194
1079	NC_013093	TCG	2	6	38410	38415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256374194
1080	NC_013093	CGT	2	6	38450	38455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256374194
1081	NC_013093	CCG	2	6	38482	38487	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256374194
1082	NC_013093	GCG	2	6	38502	38507	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256374194
1083	NC_013093	GTC	2	6	38511	38516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256374194
1084	NC_013093	GC	3	6	38521	38526	0 %	0 %	50 %	50 %	256374194
1085	NC_013093	CG	3	6	38563	38568	0 %	0 %	50 %	50 %	256374194
1086	NC_013093	CCGC	3	12	38569	38580	0 %	0 %	25 %	75 %	256374194
1087	NC_013093	TCG	2	6	38584	38589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256374194
1088	NC_013093	CG	4	8	38588	38595	0 %	0 %	50 %	50 %	256374194
1089	NC_013093	CTG	2	6	38691	38696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256374194
1090	NC_013093	TTC	2	6	38697	38702	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256374194
1091	NC_013093	CGA	2	6	38708	38713	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256374194
1092	NC_013093	CTG	2	6	38742	38747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256374194
1093	NC_013093	TGC	2	6	38755	38760	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256374194
1094	NC_013093	CGGCG	2	10	38765	38774	0 %	0 %	60 %	40 %	256374194
1095	NC_013093	TCG	2	6	38794	38799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256374194
1096	NC_013093	GCG	3	9	38830	38838	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256374194
1097	NC_013093	CCG	2	6	38848	38853	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256374194
1098	NC_013093	GCT	3	9	38873	38881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256374194
1099	NC_013093	CGC	2	6	38882	38887	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256374194
1100	NC_013093	TGG	2	6	38898	38903	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	256374194
1101	NC_013093	GCT	2	6	38924	38929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256374194
1102	NC_013093	TTCGGC	2	12	38934	38945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256374194
1103	NC_013093	TGC	2	6	38983	38988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256374194
1104	NC_013093	CCG	2	6	38989	38994	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256374194
1105	NC_013093	CGAC	2	8	38995	39002	25 %	0 %	25 %	50 %	256374194
1106	NC_013093	CGT	2	6	39020	39025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256374194
1107	NC_013093	GGT	2	6	39074	39079	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	256374194
1108	NC_013093	CGG	2	6	39092	39097	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256374194
1109	NC_013093	CGG	3	9	39121	39129	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256374194
1110	NC_013093	TCG	2	6	39136	39141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256374194
1111	NC_013093	GGC	2	6	39214	39219	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256374195
1112	NC_013093	CGC	2	6	39235	39240	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256374195
1113	NC_013093	TGG	2	6	39261	39266	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	256374195
1114	NC_013093	CG	3	6	39267	39272	0 %	0 %	50 %	50 %	256374195
1115	NC_013093	CG	4	8	39310	39317	0 %	0 %	50 %	50 %	256374195
1116	NC_013093	GCGG	3	12	39318	39329	0 %	0 %	75 %	25 %	256374195
1117	NC_013093	CGA	2	6	39352	39357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256374195
1118	NC_013093	GCG	2	6	39358	39363	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256374195
1119	NC_013093	GGA	2	6	39379	39384	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256374195
1120	NC_013093	CAA	2	6	39409	39414	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256374195
1121	NC_013093	GCTG	2	8	39429	39436	0 %	25 %	50 %	25 %	256374195
1122	NC_013093	GAC	2	6	39443	39448	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256374195
1123	NC_013093	CGA	2	6	39457	39462	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256374195
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1125	NC_013093	GCT	3	9	39514	39522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256374195
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1237	NC_013093	CG	3	6	44121	44126	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1238	NC_013093	CGGCC	2	10	44145	44154	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
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1351	NC_013093	GCC	2	6	46983	46988	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256374203
1352	NC_013093	CG	3	6	47026	47031	0 %	0 %	50 %	50 %	256374203
1353	NC_013093	CG	3	6	47033	47038	0 %	0 %	50 %	50 %	256374203
1354	NC_013093	GCCAC	2	10	47061	47070	20 %	0 %	20 %	60 %	256374203
1355	NC_013093	GAC	2	6	47082	47087	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1356	NC_013093	GAC	2	6	47161	47166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256374204
1357	NC_013093	CGT	2	6	47236	47241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256374204
1358	NC_013093	GCC	2	6	47252	47257	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256374204
1359	NC_013093	TCGC	2	8	47303	47310	0 %	25 %	25 %	50 %	256374204
1360	NC_013093	GGGT	2	8	47333	47340	0 %	25 %	75 %	0 %	256374204
1361	NC_013093	TGC	2	6	47367	47372	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256374204
1362	NC_013093	CGA	3	9	47443	47451	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256374204
1363	NC_013093	GAT	2	6	47485	47490	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256374204
1364	NC_013093	GGGCAT	2	12	47500	47511	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	256374204
1365	NC_013093	CGC	2	6	47562	47567	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256374204
1366	NC_013093	CCA	2	6	47616	47621	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256374204
1367	NC_013093	GTG	2	6	47663	47668	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	256374204
1368	NC_013093	CAG	2	6	47686	47691	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256374204
1369	NC_013093	CAGC	2	8	47707	47714	25 %	0 %	25 %	50 %	256374204
1370	NC_013093	CGC	2	6	47733	47738	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256374204
1371	NC_013093	CGG	2	6	47761	47766	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256374204
1372	NC_013093	TCGGC	2	10	47811	47820	0 %	20 %	40 %	40 %	256374204
1373	NC_013093	CTCG	2	8	47824	47831	0 %	25 %	25 %	50 %	256374204
1374	NC_013093	GC	3	6	47838	47843	0 %	0 %	50 %	50 %	256374204
1375	NC_013093	TCG	2	6	47868	47873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256374204
1376	NC_013093	CGT	2	6	48007	48012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256374204
1377	NC_013093	CTGTTC	2	12	48020	48031	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	256374204
1378	NC_013093	CCG	2	6	48120	48125	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256374204
1379	NC_013093	CGG	2	6	48130	48135	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256374204
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1482	NC_013093	GCT	2	6	51118	51123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256374206
1483	NC_013093	GAC	2	6	51137	51142	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256374206
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1485	NC_013093	CGG	2	6	51226	51231	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1486	NC_013093	CG	3	6	51255	51260	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1487	NC_013093	GC	3	6	51282	51287	0 %	0 %	50 %	50 %	256374207
1488	NC_013093	GAC	2	6	51298	51303	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256374207
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1492	NC_013093	CTC	2	6	51415	51420	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256374207
1493	NC_013093	CGA	2	6	51447	51452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256374207
1494	NC_013093	CCGA	2	8	51482	51489	25 %	0 %	25 %	50 %	256374207
1495	NC_013093	CG	4	8	51498	51505	0 %	0 %	50 %	50 %	256374207
1496	NC_013093	ACC	2	6	51524	51529	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256374207
1497	NC_013093	GGC	2	6	51577	51582	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256374207
1498	NC_013093	ACG	2	6	51602	51607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256374207
1499	NC_013093	CG	4	8	51609	51616	0 %	0 %	50 %	50 %	256374207
1500	NC_013093	CGG	3	9	51648	51656	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256374207

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